最好能够到医院的牙科做一下相关检查，查明病因以后再进行治疗。三岁孩子牙疼多数是患上了龋齿，可能是由于不良的口腔卫生所引起的，还有可能是因为平时比较喜欢吃甜食，如果不是很严重，可以采取补牙的方法进行治疗，治疗期间要注意口腔卫生，而且要少吃一些甜食或者是喝碳酸饮料。