黑色的牙结石是说明牙结石的表面还沉积了黑色素。由于烟草中的成分沉积到牙齿上就会使得牙面上有黑色斑块，甚至黑色的牙石。黑色素沉积和牙石是导致牙龈炎和牙周炎的始动因子。临床上主要使用洗牙的方法来将其去除掉。采用超声波高频震荡的方法击碎牙石使其脱离牙面，以预防和治疗牙周和牙龈的炎症。