三岁的儿童只要能够在根管治疗过程当中配合医生的治疗，根管治疗本身对儿童是不会有损害的。儿童出现了牙髓炎，建议尽早进行根管治疗，以防止炎症的扩散。但是三岁儿童在治疗过程中可能由于恐惧，导致烦躁不安、不配合，这样就会影响儿童的治疗，这种情况需要去正规的口腔医院儿童牙专科进行治疗，必要的时候需要在全麻下进行治疗。