指甲刮牙根下面酸痛可能是由于牙本质出现了过敏的现象。当牙齿受到外界的刺激后，会出现疼痛，可以使用牙膏进行清洗，这样可以起到缓解的作用；也可能是由于牙根有龋坏的原因引起的，可以到当地医院的口腔内科进行就诊，根据检查的结果对症治疗，在治疗期间一定要注意饮食。