耳朵里面疼应该不会自愈，一般是由于在清理耳朵的时候导致外耳道发炎，引起的疼痛，可以通过口服消炎药物和止痛药物来治疗。也可能是耳朵里面贮存分泌物过多引起的疼痛，最好到医院耳鼻科检查，明确病因，对症治疗，以免造成耳部感染会出现头痛、耳聋等疾病的发生。平时要以清淡饮食为主。