在医院做耳部耵聍的清理，一般是不疼的。但是如果宝宝存在耵聍栓塞，也就是耵聍聚集成团，比较硬，清理时可能会有轻微疼痛的感觉，要与宝宝提前做好工作，让宝宝配合。耵聍是外耳道的腺体分泌的一种物质，要定期进行清理，否则容易发生耵聍栓塞，引起耳部的疼痛，阻塞感以及听力下降等表现。