男孩变声期一般不会导致嗓子疼痛，男孩是变声期时，只是声音会变得比较低沉，并不会出现其他的症状。如果在变声期时出现嗓子疼痛的症状，很可能是上呼吸道感染引起的，或是存在一些咽喉部位的疾病，如急性咽喉炎、急性会厌炎或扁桃体炎等，建议及时带孩子去医院进行检查，然后再对症治疗。