真菌性鼻窦炎一般会出现头痛、鼻塞以及脓涕多等症状。由于鼻窦受到真菌感染，引起鼻粘膜充血，造成分泌物增多，从而引起鼻塞的症状出现。通常会有头部沉重感或者钝疼的现象，白天的症状比晚上较为严重。由于鼻子不能正常呼吸，由于出现鼻塞，长时间用嘴呼吸，导致脓液流入咽部，从而出现咽部慢性炎症。