一般是不能治疗脚气的。脚气通常是由于真菌感染导致的疾病，而藿香正气水通常用于治疗腹胀或呕吐的情况，另外对于头晕头痛也可以起到一定的作用，所以藿香正气水并不能治疗脚气。如果患上脚气，通常可在医生的指导下抗真菌的药物进行治疗。在治疗期间应注意脚部的清洁与卫生，避免出现感染的情况。