可能是手足口病所引起，也不排除是病毒性疱疹，导致三岁孩子手上长小水泡的原因特别多，需要让专业医生进行诊断，不要随便使用药品治疗，避免不对症反而产生不良。如果孩子长水泡同时伴随着有口部疼痛、低热等情况可能是手足口病，应该及时通过静脉注射给予抗病毒药物来治疗，还可以注射蛋白来对抗病毒。