抗菌液不可以去除灰指甲。抗菌液有杀死病菌和病毒的功效，但是灰指甲是由于真菌引起的，需要使用抗真菌的药物才能治愈。灰指甲是由于真菌病毒侵入了甲床，由于指甲甲床内药物不容易进入，所以，治疗起来就比较不容易。建议最好使用中药泡洗以后，使指甲软化，然后再涂抹抗真菌药物，这样更容易吸收。