祛除扁平疣的方法有很多，一般来说要根据扁平疣生长的部位来采取各种不同的治疗手段。如果是整个颜面部位数量比较多的话，一般建议可以选择使用一些单纯的外用的重组人干扰素凝胶的方式来阻止人类乳头瘤病毒的代谢，从根本上去除这种疾病，如果是长在四肢数量比较少，可以选择使用冷冻激光等方式把它去除掉，如果不想选择物理疗法，还可以选择使用一些扁平疣皮下埋入术进行治疗。