主要区别是症状不同，病毒性疣一般是在皮肤表面生长，而尖锐湿疣主要在生殖器官上。但是这两种疾病都具有传染性，在治疗时病程比较长，而且容易反复发作，需要在医生指导下通过物理疗法配合口服抗病毒药物综合性来治疗。服用药物期间也要注意个人卫生，要减少不洁性生活，随时到医院复查病情。