制首乌一般有毒，如果长期服用可能会刺激胃肠道，从而引起呕吐、腹泻以及肠鸣等症状，如果食用方法不对，还可能对身体造成一定的危害，如与葱、蒜、猪肉等食物一起食用，可能会出现头晕眼花的现象，严重者还会导致身体抽搐、呼吸困难等症状。另外制何首乌不能用铁质容器熬煮，可能会产生化学反应，还会导致药效降低。