治疗肛门疣的价钱大概在1000到2000元左右，具体的价格需要根据病情严重程度以及医院级别决定的，如果病情不是很严重，患者是在小型医院诊治的话，治疗费用一般比较便宜些，大概在1000元左右。如果病情比较严重，患者是在三甲医院诊治的话，治疗效果更好，费用也会高一些，大概在2000元左右。