大母指甲上有凹陷可能是身体里缺乏微量元素引起的，比如钙，也可能是指甲受到了真菌感染导致的。如果在平时吃饭时经常挑食，就会导致身体营养不足，也会导致大拇指甲上有凹陷，同时体内缺乏维生素或指甲盖受到外伤会出现这种症状，可以到医院进行相关的检查，明确病因后，在医生的指导下使用药物治疗。