早上起来指甲盖疼可能是由于晚上睡觉的时候无意之间把指甲压到了，导致早上起来的时候出现疼痛的现象。但是，指甲盖疼痛的现象也不排除有痛风的可能。建议可以去医院检查一下血尿酸，排除痛风的可能。如果排除了不是疾病原因，那就只需要平时多观察就行了。观察疼痛有没有加重，指甲有没有红肿现象，出现异常就及时的就医。