尖锐湿疣的疣体使用药物进行腐蚀治疗，可以在医生的指导下使用0.5%的鬼臼毒素酊，5%的咪喹莫特霜以及三氯醋酸或二氯醋酸等药物，进行局部的涂抹治疗。鬼臼毒素酊临床上治愈率较高，可以治愈90%以上的疣体；咪喹莫特可以清除60%以上的疣体，优点是复发率比较低。使用这些药物来治疗尖锐湿疣，都有局部刺激的副作用，都有可能出现瘙痒、灼痛、红肿、糜烂以及坏死的不良反应。