主要区别是感染的病菌不一样，传染性软疣是软疣病毒感染引起的一种疾病，尖锐湿疣是人乳头瘤病毒感染导致的，并且传染性软疣和尖锐湿疣症状也不一样，传染性软疣多表现出光泽丘疹，中央还会有软疣小体，而尖锐湿疣会出现顶端稍尖的赘生物。患者需要去医院做相关检查，明确具体病因对症治疗。