复方环磷酰胺片的副作用是可能会导致食欲不振、恶心、呕吐等胃肠道不适情况，还有可能会出现发热、喉咙异常的不适情况。这种药物也会导致生殖系统会产生毒性，会出现月经紊乱、精子缺少等情况，如果大剂量使用的话，也会导致膀胱出现纤维化情况，使用药物还是要在医生的指导下来进行使用比较好。