果糖二磷酸钠口服溶液可能会有拉肚子的副作用。部分患者还会有胃部的灼烧感，主要用于冠心病、心肌梗死以及心力衰竭等心脏类疾病的辅助治疗。肾功能衰竭的人群应避免使用，以免加重肾脏的损伤，在使用时如若有药液浑浊的情况，那么不能服用，冠心病患者往往会伴有心脏疼痛的现象。