枸橼酸铋钾颗粒主要的副作用是容易出现头晕，头痛，失眠的症状，只是少数患者会出现，而且一般是可以耐受的。还有一部分患者服药后会出现食欲减退，便秘腹泻等消化道系统的症状。还会出现舌头发黑，大便黑色。一定要与消化道出血鉴别，一般停药以后能够自行消失。长期的服用此药还容易对骨骼和肾脏造成影响。