直肠放疗后遗症可能会出现消化系统的不适，如腹痛、腹泻、腹胀、严重者会使患者出现肠粘连、肠梗阻、溃疡、穿孔等。还可能出现放射性皮炎，可能出现肛门周围的皮肤红肿、溃烂。也可能出现放射性泌尿系统疾病，是患者出现尿频尿痛尿血的情况。有部分患者在放疗几个月或半年后出现放射性肠炎的症状。