患有扁桃体癌在早期有可能会出现咽喉不适和咽喉疼痛感。有可能会在一侧出现咽痛感，疼痛感会在吞咽时比较明显，所以一般多会被患者忽视。扁桃体肿瘤晚期咽痛会出现加剧的症状，还有可能会出现同侧的反射性耳痛，讲话含糊不清，吞咽困难，呼吸困难，一侧的扁桃体有损迅速肿大的现象。有少数淋巴瘤患者会出现双侧扁桃体同时发病。