糖类抗原199也是临床上床用的在肿瘤标记物之一，可以用于恶性肿瘤的筛查，其中消化系统的胃癌、胰腺癌，以及结肠癌、直肠癌等，都有可能导致该指标的升高。但指标没有特异性，不能作为恶性肿瘤确诊的依据，如果检查结果略高于正常的，也有可能是由于炎症，或者良性肿瘤所导致的。如果明显升高的，则需要警惕恶性肿瘤的可能性。