会厌囊肿是良性肿物，如囊肿小，常无明显感觉，只是在做喉镜检查时，偶尔被发现。如囊肿小，无症状者可以不予治疗，定期观察随访。如囊肿比较大，有咽喉部不适，或因为囊肿大而影响呼吸及吞咽功能，需要在直接喉镜下行会厌囊肿切除手术治疗。