甲状舌骨囊肿切除术时，可以采取全身麻醉的方式，患者手术时不会有痛苦的感觉。在麻醉后，术野常规进行消毒，铺无菌巾被，在囊肿的表面顺皮纹做一个横行的切口，切口皮肤，钝性分离皮下组织，暴露囊肿，探查是否存在瘘管，逐渐的分离囊肿，直达舌骨处，剪除舌骨的中段部分，如果存在瘘管，需要将瘘管以及周围部分肌肉组织一并切除，在基底部结扎。冲洗后以及彻底止血后，防止引流条，逐层缝合。