氟西汀和舍曲林的区别应该是服用药物以后不良反应有所不同，同时药物的治疗效果也不一样，氟西汀和舍曲林都是用于抑郁症疾病的治疗。氟西汀可以治疗强迫症或者抑郁症发作期间的治疗，舍曲林可以用于焦虑症或者抑郁症心理病症的治疗，具体需要医生结合病情的状况指导用药。