磷霉素氨丁三醇散的副作用一般有腹泻、恶心及皮疹等不良反应。磷霉素氨丁三醇散主要是用于治疗敏感细菌感染引发的下尿路感染等现象，大部分患者在使用该药物的过程中是不会出现明显的不良反应的，少部分患者可能因为自身体质或者药物用量的原因，有可能会引发以上不良反应的出现。