低聚异麦芽糖本身不会对身体造成明显的危害，但和某种药物在一起吃的情况下，有可能会产生药物相互作用，引起胃部不适症状。在平时如果身体不适，需要服用别的药物，要遵医嘱和低聚异麦糖的服用时间间隔两小时，避免阻碍身体对药物的吸收，使药效降低，患有便秘的患者平时还可以多吃些粗纤维的食物，比如芹菜和韭菜，能够加快肠胃的蠕动，有利于便秘的恢复。