一般可以一起吃，如果担心两者药物会产生影响，在服用药物时需要间隔一小时到两小时。益生菌可以起到调节肠道菌群的作用，有利于辅助改善身体出现的腹痛和腹胀，酵素也可起到辅助治疗消化不良的症状，但用药时一定要在医生的指导下，根据自身的体质来选择具体的药物，尽量不要服用过量。