通常是药物的效果不同，固本益肠片一般可以起到健脾温肾的作用，并且还可以起到涩肠止泻的功效，通常可以用于治疗脾虚或者是肾虚等疾病所引起的症状。补脾益肠丸一般可以起到补中益气的作用，并且还可以起到健脾和胃以及涩肠止泻的功效，主要是用于治疗脾虚。