川乌与草乌主要区别是治疗的疾病和功效不同。川乌主要治疗四肢麻木以及半身不遂的疾病，主要功效是舒经通络和驱寒止痛，特别是风寒头痛的患者，治疗上有一定的效果。草乌主要有散寒的功效，如果是中风的患者，可以用草乌来进行治疗，可以使病情得到一定的缓解，可以在医生指导下进行服用。