益生元吃的最佳时间一般是在早晨空腹或者是晚饭后吃一次是比较好的，它是一种膳食补充剂，可以促进和改善胃肠道食物的消化，使胃肠道功能失调的情况得到缓解，调节肠道菌群失调，当宝宝出现有偏食，腹胀，恶心，呕吐等的情况，是可以在医生的指导下，根据宝宝的年龄和体格发育，适当的给予益生元来治疗的。