左旋肉碱的副作用，可能会导致出现有恶心，呕吐等消化道不适，并且也会导致有心率加快，心悸等的情况发生，因此长期服用左旋肉碱对消化系统和心脏系统会造成不利的影响。因此当有减肥的情况最好不要长期服用左旋肉碱，平时给予控制饮食，运动进行减肥，则是比较健康的。