男性霉菌的治疗方法可以在医生的指导下口服制霉菌素等药物来进行治疗，最好是夫妻同治，很有可能是由于女性的霉菌性阴道炎，交叉感染所引起，在治疗期间尽量不要有性生活，如果不良的性生活很有可能会导致病情加重，会出现夫妻交叉感染，定期到医院复查。