阴茎勃起后疼痛主要原因有阴茎损伤、尿道炎症以及肿瘤等。阴茎损伤多见于外伤，过度自慰以及性生活时过于激烈也可以导致海绵体及尿道受损，阴茎勃起后出现疼痛，尿道炎症时也会引起勃起疼痛，需要做尿常规以及尿道分泌物培养，确诊后需要抗感染治疗。