治疗肺栓塞的最好的药可以选择抗凝和抗溶栓的药物，也可以使用肝素的药物来进行治疗，抗凝的药物可以防止血栓增大，防止新血栓形成。肺栓塞主要是静脉系统有新的血栓阻塞肺动脉所引起的疾病，一般都会导致呼吸不通畅、胸闷、呼吸困难、咳嗽等症状，一定要谨遵医嘱用药治疗，严重情况下可以选择手术治疗。