发烧屁股两侧酸痛是考虑是由于患者有关节炎，也不排除是强直性脊柱炎骶髂关节疼痛。如果在发烧时出现屁股两侧酸痛的症状，应及时到正规医院的骨科进行血常规以及骨盆的X片明确具体的病因，需要在医生指导下服用消炎抗感染的药物进行治疗。在平时患者可以多食用富含有营养的食物，也有利于身体的康复。