正庚烷对皮肤有轻微的刺激，一种易挥发的液体，而且很容易引起呼吸道中毒而且长期接触到污染的空气，可能会引起神经衰弱等。呼吸道中毒后通常就会表现出恶心以及厌食症状，而且麻醉的作用可能会引起木僵症状，甚至是意识丧失等严重的表现。正庚烷属于有机化合物可作为麻醉剂使用。