很高，吉兰巴雷综合征85%的患者在1～3年完全恢复，少数患者留有长期后遗症，病死率约为5%。常见死因为严重全身性感染、肺栓塞、心肌梗死、心力衰竭与心律失常、成人呼吸窘迫综合症等。老年患者有严重神经轴索变性，辅助呼吸时间超过1个月或进展快且伴有严重自主神经功能障碍者，预后不良。约3%的患者可以出现1次以上的复发，复发间隔可数月至数十年。