从你描述的情况来分析，作为女性应该在过了生理期以后的其他时间，来进行肠镜的检查。主要是由于排黑色的大便，说明有消化道出血的可能，所以在生理期期间，不能做此种检查，影响医生的操作以及对检查结果也会有一定的影响。这种情况下，建议你咨询医生，预约具体的时间以及注意事项。