三个月婴儿消化不良可以适当的采取热敷以及按摩，有助于促动肠道蠕动和食物消化，对于症状也会有所改善，幼儿时期体内的消化系统还没有发育完善，如果存在必须用药，一定要谨遵医嘱，不可盲目，以免导致胃部粘膜受损引起呕吐现象。并且母乳喂养，大人一定要禁止吃刺激食物以及生冷食物。