对于真菌性食管炎的患者来说可以在医生的指导下服用具有抗真菌功效的药物进行治疗，效果是最为理想的。不过抗真菌类的药物种类比较多，不建议患者自行选择，而是应该由医生帮忙选择。除此之外，在治疗真菌性食管炎期间，患者应注意养成良好的生活与饮食习惯，以免给治疗带来不利影响。