肛门镜和肠镜的区别，主要就在于检查的部位不同。肛门镜，只对进入肛门内的小段肠管壁起到检查的作用，主要就用于诊断内痔、直肠下段的息肉或者肿瘤、肛窦炎等疾病。肠镜的检查范围则比较广泛，对于直肠、乙状结肠、降结肠，横结肠，升结肠等整个结肠部位都可以进行检查。