月经过后肚子疼，并且连着后腰也疼，主要考虑妇科方面的炎症，建议去医院化验个血尿常规和白带常规检查，也要做个腹部超声，排除是否存在盆腔炎或子宫内膜炎等疾病。如果排除这方面的原因，也有可能是月经期间着凉或者食用了生冷食物有关。存在腰肌劳损也是会出现这种症状的，建议明确诊断后及时治疗。