一般是不能做的，在月经期间身体抵抗力是比较弱的，而肠镜检查是一种有创性检查方式，检查时可能会有肠道壁损伤的现象，从而会诱发出血。要等月经完全走完后7天左右，到正规医院去做检查，检查时需要注意空腹，避免吃任何的食物，同时要遵医嘱服用一些清洁肠道的药物。检查时间可能需要30分钟左右。