黄连素是可以治疗肠炎的，黄连素具有一定的抗菌消炎对抗肠道病原菌的作用，对于细菌性的肠炎、腹泻是有很好的治疗效果的。可以使用黄连素进行治疗，另外还可以多喝点淡盐水，淡盐水可以补充体内的水分和电解质，同样盐水也有一定的消炎作用，可以利用盐水冲刷肠道，排出体内的病原微生物，减轻胃肠炎症的症状。