会对患者的肠道黏膜产生损伤，甚至还会引起肠穿孔或者是交叉感染等风险。由于人体肠道内的环境比较复杂，做肠镜检查的时候，需要把专业的内置镜深入到患者的肠道中，对肠道内的环境进行观察，因此在操作过程中，如果操作不当，可能会对肠黏膜产生危害，但危害比较轻，大多患者在休息一段时间之后就会缓解。