功能性消化不良的症状可能不会自愈。一般出现功能性消化不良，会出现腹痛和腹胀以及腹泻等症状，如果不进行治疗会造成消化功能减退以及营养不良的情况发生。在出现这种疾病时，需要在医生的指导下口服消炎和抑制胃酸分泌以及保做胃动力的药物治疗，在治疗期间要以清淡和易消化的食物为主。